Могут появляться тикообразные гиперкинезы, головокружения, обмороки, рассеянная неврологическая симптоматика, субфебрилитет. У девочек выявляются нарушения в менструальном цикле, чаще задержка в половом созревании. Кроме поражения нервной системы для этой формы хронического тонзиллита характерен геморрагический синдром, проявляющийся в частых носовых кровотечениях, геморрагиях в области голеней и предплечий, в ряде случаев в микрогематурии.

Хроническому тонзиллиту присущи также артралгии, мышечные боли.
Признаки поражения сердечно-сосудистой системы возникают рано. Появляется одышка при ходьбе, колющие боли в области сердца, сердцебиение, лабильность пульса. Может быть повышено артериальное давление. Расширение границ сердца, даже небольшое, наблюдается редко. Первый тон сердца может быть приглушен, но может быть и громким. У большинства больных выслушивается систолический шум с преимущественной локализацией в V точке, реже на верхушке и легочной артерии. Систолический шум разной длительности и интенсивности, как правило, уменьшается в вертикальном положении и не иррадирует за пределы сердца.
В ранние сроки тонзиллогенной интоксикации и в периоды обострения хронического тонзиллита увеличивается зубец Pi-2 ЭКГ, одновременно на фоне тахикардии уменьшается его длительность, а также длительность интервала Р - Q и комплекса QRS, что обусловлено повышенными симпатическими влияниями.