Если лечение неэффективно, ребенку дают парентерально препараты железа феррум-лек или фербитол (содержание гемоглобина у этих больных должно быть не менее 15-16 г%). В случае безуспешности лечения и сохранения приступов показаны трансфузии крови или эритроцитарной массы.

Если гипоксемические приступы проходят без потери сознания, необходимы кислород, седативная терапия (димедрол, пипольфен, промедол), кордиамин. При длительных и тяжелых приступах с потерей сознания лечение проводится по схеме, включающей нередко и неотложную хирургическую помощь.
Мозговые осложнения в виде гемипараличей или парезов могут развиваться на фоне гипоксемического приступа (стаз в мозговых сосудах) либо в результате парадоксальной эмболии, возникающей при шунте крови справа налево. Лечение таких больных проводится с участием педиатра-невропатолога.
Для предупреждения мозговых осложнений ребенок с синим врожденным пороком сердца должен получать достаточное количество жидкости. У детей в терминальной фазе болезни при развитии мозговых осложнений исследуются свертывающая и антисвертывающая системы для решения вопросов о патогенезе нарушений (тромбоз, кровоизлияние) и проведения соответствующей терапии.